Действие разворачивается в Токио спустя год после масштабного столкновения Годзиллы с боевым роботом Мехагодзиллой, созданным специально для защиты Японии от древнего чудовища. Жители мегаполиса только начинают восстанавливаться после последствий битвы, как перед ними возникает новая угроза, связанная с легендами о монстрах, которые считались частью далекого прошлого.
